主任的要职。阅人无数的老专家慧眼识珠，一再破格重用，还曾在一次关于创作的报告中公开表扬：“作曲家最好能成为民间音乐的宝库，懂得很多，像于会泳同志就是这样……”赞誉有加。
这份赞誉来得并不容易，在人才济济的高等学府里，自知不足的于会泳存有危机感，唯有勤能补拙方能立足。他充分利用学院里优越的生态环境，不断提升自己各方面素养。在主业上成果累累，编著出版了《山东大鼓》《胶东民间歌曲选》《陕北榆林小曲》《单弦牌子曲分析》等。
教书育人方面也做了不少开拓性建设工作，他新开设了“民间曲调研究”和“腔词关系研究”两门选修课，白手起家，亲手编写教材，把满腹民歌翻出来用于教学，非常生动，陈应时教授正是于会泳当年的学生。后来，这两门由他创立的选修课升格为本科作曲一系、二系的必修科目，由他编写的教材一直沿用至今。2008年中央音乐学院出版社发行了这两本书，共约60万字，为音乐理论教育填补了空白。
我国民间音乐如一地散落的珍珠，亟须专门加以梳理、归纳、研究，提升到理论高度，逐步形成一套独立体系。于会泳在音乐理论上有独立创见颇有建树。他的学术论文《关于我国民间调式的命名》和《关于辨别调式问题》具有甚高的学术价值。在论文中提出借鉴西方乐理，用宫商角徵羽音名来命名中国调式，据说黎英海先生亦有同见，引发全国同行热议一致赞同，并在全国学界推广。我学习使用了半个多世纪，今日才知道于会泳是中国调式命名人之一。他还提出了“主宰音程关系”的新概念等（下文有详介）。作为一名学者，他是个能从书堆里钻得出来、有独立思考、思维活跃的智者，这些建设性成果留下了一笔精神财富。